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En junio de 2008 se presentó querella contra el Ministro de Defensa israelí, Benjamín Be-Eliezer, y 6 personas bajo sus órdenes por un delito contra la humanidad por un ataque "desproporcionado," el bombardeo israelí en 2002 llevado a cabo con un caza F16 en el barrio de Al Daraj (Gaza) para destruir la casa del presunto dirigente de Hamas, Sala Shehaden. El bombardeo  causó la muerte de 15 personas, la mayoría niños, y 150 heridos. 

La querella fue admitida a trámite en enero de 2009 al estimar el juez instructor que, aunque se hubiera investigado el caso (en el cual el Tribunal Supremo israelí se limitó a dar por buena "la decisión de la Fiscalía Militar de no abrir una investigación criminal sobre los hechos), de la Convención de Ginebra se desprende la competencia "concurrente" del tribunal español, dada la naturaleza de los delitos investigados (crímenes de guerra), la Fiscalía se opuso a la competencia de los tribunales españoles y se ordenó el archivo debido al “carácter preferente de la jurisdicción del Estado donde tales hechos fueron cometidos” y que la documentación presentada por Israel (aportada después de admitida la querella) demuestra que existen procedimientos abiertos en Israel. Esta decisión ignora que los territorios de Gaza no pertenecen al Estado de Israel.

Finalmente, el pasado mes de junio de 2009 el pleno de la Sala de lo Penal de la Audiencia Nacional acordó archivar definitivamente la causa. Las acusaciones han presentado un recurso de casación ante Tribunal Supremo el 21 de septiembre de 2009.