La modalidad de violencia sexual que más se denuncia en Burundi es la violación, cometida tanto por agentes del Estado como no estatales. La violación de mujeres y niñas es frecuente en el hogar y en la comunidad, y es un problema ampliamente extendido por todo el país. Las autoridades burundesas no están ejerciendo la diligencia debida para impedir, investigar y castigar esta violación de derechos humanos.

La violación, abuso oculto contra los derechos humanos. AFR 16/006/2004. El aumento de casos de violación a mujeres cometidos por miembros de las Fuerzas Armadas de Burundi, Grupos Políticos Armados y bandas criminales es alarmante. Las violaciones son usadas como arma de guerra y terrorismo contra la población civil y una de sus consecuencias es el contagio del VIH y otras enfermedades.